动画《潜行吧!奈亚子W》根据逢空万太创作的轻小说《潜行吧!奈亚子》改编,是TV动画《潜行吧!奈亚子》的第2期作品。高中生少年八坂真寻的面前突然出现了一位银发碧眼的美少女,她自称是克苏鲁神话中登场的邪神·奈亚拉托提普,并且是宇宙人。从那以后,以奈亚子和真寻为中心的邪神(宇宙人)和地球人所引起的尽是麻烦的每一天开始了。